好得罪人，已有人替他的安全担心了。
在南京的陶成章的同乡、时任临时参议院议员王庆即写信提醒陶成章“先生在沪大不利”。
陶成章也知道自己把陈其美得罪了，可能埋下隐患；但是，陶成章在沪养病的同时，尚在为北伐做准备而募兵，一时难以离开上海。所以，虽然自知身处险境，却仍得继续留沪不思离去；只是，起居出行比以往心谨慎多了。
为防不测，陶成章离开了原来下榻的客利旅馆，避居到了国民联合会、光复会机关所等地；最后，躲到了法租界的广慈医院内。此一时期，陶成章连写给妻子的信函，署名也用了“东生”等化名，以免自己的行踪被人发觉；如此，陶成章也可谓是倍加心了。
然而，蒋介石鬼得很；经过一番周折后，最后还是将陶成章的居地探知到了。
一九一二年一月十四日凌晨，静寂的广慈医院内忽然响起一声骇人的枪声。值班的医生、护士赶紧察视，只见两个黑影趁着夜色鬼鬼祟祟地窜出医院。众人猜测定是出事了，赶忙遁声跑至二楼查看；果然发现，刚才还在酣睡中的陶成章，此时已是饮弹躺于血泊之中；就这样，年仅三十五岁的陶成章死于非命了。
陶成章遇害的消息传出后举国震惊，舆论纷纷要求当局查缉凶犯严厉惩处。
虽然，陶成章曾经多次对孙中山发难，给孙中山有过很大的伤害；但当孙中山闻知陶成章竟然被人暗杀时，也深感惊愕了，为革命党失去这么一位虽令人头疼却又使人尊崇的领袖人物而深感痛惜。
翌日，孙中山即致电陈其美，严令：“缉拿凶犯，治罪正法；以泄天下共愤，告慰逝者英灵。”同时，指令“务须保护章太炎君”。
而此时的陈其美毕竟心虚，不敢向孙中山明言；且见此事已引起了国人共愤，唯恐被人找到线索而真相大白，赶紧吩咐蒋介石离开上海；于是，蒋介石再次东渡躲避到日本去了。
同时，陈其美又装模作样地摆出了一付严查凶犯的姿态；但可想而知，陈其美查缉多时，却是一无所获。
而国人中虽有人怀疑此事乃陈其美所为，但因无凭无据倒也不能妄加指控，只盼着能有个水落石出之时。
而事发后，王竹卿顾自回嘉兴老家去了；因陶成章严斥王竹卿的事尽人皆知，有人自然的怀疑到或许是他报复杀人；于是，决定将王竹卿逮来询问以查明真相。
然而，当光复会同仁前往嘉兴时；王竹卿自知事情已经败露，即顽抗拒捕，结果被同仁当场击毙。
王竹卿死后，可查的线索断了，这倒使陈其美松了口气；因为，可以金蝉脱壳了。于是，扬言“凶犯已经伏法”，欲以此障人耳目。
国人虽仍有存疑者，但终因没有发现新的线索而未有进展；时间长了，也就不了了之。因此，曾经轰动一时的陶成章被刺杀案也就成了一个难以解开的谜，而让人揣测、猜疑，令人萦怀。
陶成章死后，光复会没了领军人物。曾经在中国政坛上扮演重要角色的光复会，此时已是一蹶不振树倒猢狲散了。
不久，广东的同盟会与光复会之间矛盾又白热化了，两会之间时有冲突并间有流血。
因在提名中华民国教育总长时遭到挫折的章太炎，则在《大共和日报》上发表《致孙中山******》，谴责同盟会与光复会之间的自相残杀。
于是，孙中山即以中华民国临时大总统的名义致电时任代理广东都督陈炯明，希望调解两会冲突停止争斗以免兄弟阋墙。
然而，陈炯明根本不把孙中山的话当会事而仍我行我素；结果，孙中山的调解未能奏效。数月后，陈炯明手下的清军降将吴祥达，在汕头捕杀了南部光复军司令许雪湫；至此，光复会在南方仅存的一支武装也随之解体了。
章太炎闻后，愤而道：“革命成功，革命党亡！”而将许雪湫的被杀及光复会的解体，都怪罪在了孙中山的头上；此后，章太炎辞去了孙中山聘其为总统府枢密顾问之职。
章太炎再次与孙中山分道扬镳后，与程德全等人办了个中华民国联合会，又处处与孙中山为难了。而光复会至此已不再存在，彻底退出了中国的历史舞台。此是后话，顺提而不赘述。
却，南北和议初步谈妥后，剩下的问题就是迫使清帝退位了。
为达目的，袁世凯先设法用重金买通了庆亲王奕劻；奕劻被买通后，袁世凯觉得已到该与清庭摊牌的时候了。
于是，一月十六日，袁世凯进宫，故意向隆裕太后哭诉：“党人嚣张难阻，海军助纣为虐；北洋军虽尽力御敌，且有杯水车薪之虞，无法防护京、津；且而今人心涣散，如江河日下，社稷危在旦夕；若再不设法，则大清宗庙将无存矣。故而，臣以为，不若顺势而为，变更国体，实行共和，以换取对清室之优待；如此，当能保宗庙，使清室免遭蹂躏。”
听袁世凯如此，隆裕太后不由得泪流满面了；她知道，自己孤儿寡母的，满朝官员中已无人可靠，只指望着袁世凯能忠心勤王了；想不到，而今的袁世凯
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